1945年,盟军突入德国,德国疯狂科学家李然博士研究的项目----科学怪人法兰克的心脏被潜艇秘密转移到了其同盟国日本的广岛陆军医院,供起研究出不死的士兵,然而核子爆炸使一切化为灰勁.十五年后,科学家在广岛研究核子放射能对人类还有环境的研究中,意外的发先了一个孩子,在检测中发现其虽然受过核子放射能的照射,但一点都没有被污染,经过调查发现原来这个孩子在核子爆炸后迷一样的出现在广岛的英树医院(原广岛陆军医院),而且他还在不停的变大,所以科学家们推测当年的法兰克的心脏在受到了放射能的影响后,发生了异变,他们称其为广岛怪人法兰克.然而这时的法兰克已经变大到人们不可控制的地步,并且逃出了医院,另一方面,在秋田油田,出现了地底怪兽,最后两只巨大的生物在平原相遇,并进行了激烈的战斗,最后法兰克用火战胜了地底怪兽,然而与此同时一只大章鱼在悄悄的接近他.........

不谙世事的少年意外来到阴暗的地底世界，遭遇了奇异的地底怪物，他时而温顺可爱，时而暴戾可怖。一段关于少年的成长奇旅，地底冒险即将开启。有些事，重要的不是真相，而是人们心里想要的那个答案

Agroupoffriendsfindthemselveshunteddowninthecavesbyacreature...fromanotherworld.

鸣人（竹内顺子配音）、小樱（中村千绘配音）和鹿丸三人进入深山寻找走失的雪貂，在回来的路上，他们遭到全副武装的骑士团的袭击。在激烈的对抗中，鸣人和对方的白甲头目特穆金一同跌落悬崖，两人被刚巧路过的商队所救。一路上，两个对手慢慢开始了解，继而得知特穆金要建立一个没有战争和灾难的乌托邦，而鸣人具有的神奇力量正是他们所需要的。与此同时，鹿丸则和小樱目击到一个巨型堡垒，他们发现堡垒四周满是穿着铠甲的武士。鹿丸偷偷潜入侦查，看见一群被禁锢在容器中的小孩，并听到关于吉鲁遗产的谈话。这与特穆金之间究竟有什么样的关联？　　本片为《火影忍者》第二部剧场版动画。