即使是处于和平安宁的环境里，日本依然每年有8万4千的失踪报案。主人公相良凌介（西岛秀俊饰）一家四口人原本过着幸福的日子，但某天，妻子和孩子们突然消失，凌介也因此受到了媒体的关注。凌介苦苦寻找家人，却没有任何进展。此时网络上突然出现的信息爆料直指凌介可能谋杀了自己的妻儿。凌介在公众面前就毫无征兆地瞬间从失去妻儿的悲情丈夫变成了人人喊打的恶棍。网络舆论在一瞬间排山倒海般倾倒，凌介在焦虑和担心中还是决定和警察一起寻找自己的家人，但就在寻找的同时，一连串蹊跷的事情发生在他的职场与生活环境中：突然一具遗体被大件邮送到他的职场；突然又是失踪女儿的鞋子被发现丢在新房地基的水泥里；突然又是儿子失踪时随身携带的物品出现在家门口……经过不懈的努力，他和警方终于发现了家人失踪的蛛丝马迹。

刑警队长兰少平因工作失误被革职。被革职的兰少平发现“罪案实录摄影展”的冠军作品表现的是一起有预谋的谋杀案，可其他刑警都不同意这种说法，作者金佑昆说是她的偶然发然。冲破重重阻力，兰少平的调查有了进展，他在金家找到了凶器，但一直到暗恋金佑坤的冯大可的出现才使案情真相大白……

2000年夏季的某个清晨，一个年轻美貌的单身女人赤裸地暴死在自己的床上。是情杀？奸杀？还是仇杀？西峰市刑警大队的干警们就此展开了一系列的调查。可是，当刑警们展开侦破时却发现整个案情扑朔迷离，死者王玲生前生活在纸醉金迷之中，并拥有众多的情人；除了死者的通讯录、手机等物品蹊跷的丢失外，现场并未发现凶手的蛛丝马迹。案件的调查漫无头绪，真凶是谁？是鬼鬼祟祟的男邻居，是经常偷窥她的强奸前科犯；还是她的情夫……

罗城某夜，刑警大队突然接到报警电话，一小区发生枪案。值班探长大刘和警员孟津赴现场，发现却是个杀狗案。看到别人都在忙大案，立功心切的年轻警官孟津感觉很委屈，但大刘说服孟津对该案进行详细查访。出发之前，大刘的儿子被人在校外打伤住院，大刘却没有时间去看孩子。雪上加霜的是，孟津的女友要求孟津调离刑警岗位，否则就分手。　　孟津向女友表示了抱歉分享者影视，女友含泪离去。此时，市中心医院又发生持枪抢劫案。专案组对弹道进行了分析，大刘等人再一次发现“杀狗枪”的踪迹。医院抢劫案线索渐渐集中在了李成和身上，专案组通过上级在物力财力上的支持，运用科学技术手段、大量排查线索等方式对案件侦破有了新的进展。通过努力专案组进一步掌握了案犯情况，开始对重点地区加强警戒力量，最后将罪犯丁三等抓获。罗城恢复了往日的平静。

平成20年，在静冈县的国道高架桥下发现了杀人事件。而调查此次案件的静冈县警裾野署的警察日下悟发现，在昭和49年时须藤就已经和妻子离婚、当时住在静冈年幼的儿子尾畑守因诱拐杀人案件而去世。这个事件的时效成立一年前的昭和63年，由静冈县警本部长榛康秀所发出的指示而成立了特别搜查班。此后，非正式编制却升入警视厅的重藤成一郎成为管理官，率领着六个有能力的警察再次展开调查。

12月26日23時からは、『あなたの番です劇場版』の登場人物たちが集まって、『真犯人フラグ』の事件を推理するという特別編を放送。凌介の親友・日野（迫田孝也）が営む　BAR「至上の時」で忘年会をしようと集まったのは、久住譲（袴田吉彦）、シンイー（金澤美穂）、尾野幹葉（奈緒）、藤井淳史（片桐仁）、赤池美里（峯村リエ）らキウンクエ蔵前の住人。榎本早苗（木村多江）と正志（阪田マサノブ）もやって来て、話題の炊飯器失踪事件の推理を始める。そこへ、瑞穂と一星も現れる。