上古十大神器“太一轮”，因在其刻上了“太白克太辰”，使得历史产生了巨大的变化。太白帝国由于量产“机关兽”，并用其强大的武力掌握了神州大地。但野心无垠，太白帝国为了追求比神州大地更辽阔的版图，意图取得天下。时为太白历99年。太白帝国疆土底下烽烟四起，天下各地都持续着帝国与反抗军的战斗。在用古代动力驱动的帝国“机关兽”面前，一名反抗军少女手持传说中神器之一“轩辕剑”挺身而出。而那时，少女的青梅竹马少年却沦为帝国的奴隶。命运使然，即使少年的聚落曾被袭击，他仍然无法自拔地深陷于机关术的魅力之中。在历经了生离死别各种造化之后，两人皆以为与对方生死相别却又重逢时，众人的命运，也尽被卷入了历史的滚滚浪涛之中。

位于叶佩特斯半岛，以700年历史而自豪的大国——奥尔坦西亚王国。　　王国的丰穰土地受到周边国的觊觎，数次暴露在侵略的威胁之下，但侍奉王国的两大公国——奥利维亚公国和科美利亚公国化作王国的剑和盾，使得王国在漫长的岁月中免于战祸。　　然而，圣王历767年12月5日，科美利亚公国突然对奥尔坦西亚王国掀起反旗。　　科美利亚公国的反叛，以及在叛乱的同时现身的魔物，使得奥尔坦西亚王国迎来了混乱时代……　　在战乱的世间，陷身于多舛命运之中的骑士们。　　由悲剧开始，宿命的继承与战斗，就此启动。

故事发生在一个虚构的奇幻世界之中，在这里，人类不再被局限于陆地之上，而是可以自由的翱翔在天空中。地域的不受限促使一种名为“飞翔马戏团”的运动诞生了。少年日向晶也（逢坂良太配音）曾经是这一领域内的种子选手，被寄予厚望，然而，在一次惨败之后，晶也彻底放弃了梦想和希望，之后一直都过着浑浑噩噩的生活。　　一次偶然中，晶也和一位名为仓科明日香（福圆美里配音）的转校生相遇了，在明日香的引导和鼓励之下，晶也对于飞翔马戏团运动的热情被重新点燃。然而，他离开赛场已经太久了，再度回到舞台的中心，他能否恢复曾经的强劲实力呢？

1996年、人類は地球を飛び出して火星に進出したが、アメリカとソ連の冷戦もまた火星にまで拡大していた。同年10月3日、国連主催のコズミック・カルチャー・クラブ（宇宙体験教室）に選ばれた少年少女達は、火星に到着して間もなく、突如現われた謎の機動兵器・SPTによる攻撃に晒されてしまう。そんな窮地に陥った彼らを救ったのは、青いSPTを駆る少年アルバトロ・ナル・エイジ・アスカであった。彼はグラドス星によって地球が狙われていること、そして自分が地球とグラドスの混血であることを告げる。コズミック・カルチャー・クラブの少年少女達は、エイジに不信の眼差しを向けながらも、戦いの中で徐々に絆を深めていく。そして共に地球に帰る為、彼らは火星を脱出し苦しい旅に出発した。

未来，人类历史发生断片。旧有的社会体系烟消云散，地球形貌发生巨大的改变。而今这个经过“新人类”精心设计的人工世界依靠环境维持装置运行，人们深藏在生命的起点——海洋的深处求生，望着那从未停歇的海雪，心中充满置身于无尽虚空的孤独与彷徨。为了了解过去人类的历史，现在的人们成立了“还原记录发掘局”，他们从废墟内寻找影响记录的碎片，拼凑还原着自己所丢失的历史记忆。青年有罗（中尾みち雄配音）便是发掘局的一员，当同事们忧伤的接连辞职而去，他仍执迷于发现历史的喜悦之中。这一日，有罗发现一段罕见的带有声音的记录，他试图与分析部门的理子（川島美菜子配音）合作复原这段记录。人类因为又不想失去的东西而保存了“记录”，可是现在为止发现的“记录”有保存下来的东西吗？等待有罗的将是怎样的冲击……